Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm27Q5SFM8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm27Q5SFM8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm27Q5SFM8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm27Q5SFM8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm27Q5SFM8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm27Q5SFM8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm27Q5SFM8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm27Q5SFM8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm27Q5SFM8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm27Q5SFM8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm27Q5SFM8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm27Q5SFM8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm27Q5SFM8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm27Q5SFM8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm27Q5SFM8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm27Q5SFM8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm27Q5SFM8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm27Q5SFM8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm27Q5SFM8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm27Q5SFM8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms