Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI5

Brsk1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk1Q5RJI5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brsk1Q5RJI5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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Brsk1Q5RJI5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Brsk1Q5RJI5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Brsk1Q5RJI5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Brsk1Q5RJI5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Brsk1Q5RJI5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Brsk1Q5RJI5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brsk1Q5RJI5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brsk1Q5RJI5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brsk1Q5RJI5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brsk1Q5RJI5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brsk1Q5RJI5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brsk1Q5RJI5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Brsk1Q5RJI5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brsk1Q5RJI5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms