Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1F6

Trav5d-4, T cell receptor alpha variable 5D-4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav5d-4Q5R1F6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav5d-4Q5R1F6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav5d-4Q5R1F6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav5d-4Q5R1F6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav5d-4Q5R1F6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav5d-4Q5R1F6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav5d-4Q5R1F6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav5d-4Q5R1F6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav5d-4Q5R1F6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav5d-4Q5R1F6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav5d-4Q5R1F6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav5d-4Q5R1F6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav5d-4Q5R1F6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav5d-4Q5R1F6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav5d-4Q5R1F6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav5d-4Q5R1F6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav5d-4Q5R1F6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav5d-4Q5R1F6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav5d-4Q5R1F6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav5d-4Q5R1F6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav5d-4Q5R1F6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav5d-4Q5R1F6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav5d-4Q5R1F6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav5d-4Q5R1F6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav5d-4Q5R1F6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms