Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Rapgef6Q5NCJ1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rapgef6Q5NCJ1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms