Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfmbt2Q5DTW2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfmbt2Q5DTW2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms