Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f8Q58FA4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f8Q58FA4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms