Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmtc2Q56A06 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmtc2Q56A06 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms