Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrig2Q52KR2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrig2Q52KR2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms