Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Spire1Q52KF3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Spire1Q52KF3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms