Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otol1Q4ZJM7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otol1Q4ZJM7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms