Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZGD9

Nxf3, Nuclear RNA export factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf3Q4ZGD9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nxf3Q4ZGD9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nxf3Q4ZGD9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms