Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZGD8

Nxf2, Nuclear RNA export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf2Q4ZGD8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nxf2Q4ZGD8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nxf2Q4ZGD8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms