Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL18

Tmem171, Transmembrane protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem171Q4KL18 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem171Q4KL18 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem171Q4KL18 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem171Q4KL18 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem171Q4KL18 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms