Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd5Q3V1H9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd5Q3V1H9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms