Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ckap2Q3V1H1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ckap2Q3V1H1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap2Q3V1H1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms