Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp48Q3V0C5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp48Q3V0C5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms