Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SvipQ3UZP4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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SvipQ3UZP4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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SvipQ3UZP4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms