Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnpc3Q3UZ01 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnpc3Q3UZ01 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnpc3Q3UZ01 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnpc3Q3UZ01 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnpc3Q3UZ01 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnpc3Q3UZ01 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnpc3Q3UZ01 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnpc3Q3UZ01 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnpc3Q3UZ01 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnpc3Q3UZ01 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rnpc3Q3UZ01 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rnpc3Q3UZ01 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnpc3Q3UZ01 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnpc3Q3UZ01 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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