Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Capn13Q3UW68 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn13Q3UW68 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms