Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chpf2Q3UU43 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Chpf2Q3UU43 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms