Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf48Q3US17 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf48Q3US17 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms