Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR97

Snx21, Sorting nexin-21, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx21Q3UR97 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx21Q3UR97 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx21Q3UR97 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx21Q3UR97 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snx21Q3UR97 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx21Q3UR97 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx21Q3UR97 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx21Q3UR97 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx21Q3UR97 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx21Q3UR97 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx21Q3UR97 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms