Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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D13Ertd608eQ3UPR8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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D13Ertd608eQ3UPR8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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D13Ertd608eQ3UPR8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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D13Ertd608eQ3UPR8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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D13Ertd608eQ3UPR8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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D13Ertd608eQ3UPR8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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