Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep63Q3UPP8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep63Q3UPP8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep63Q3UPP8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep63Q3UPP8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep63Q3UPP8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep63Q3UPP8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep63Q3UPP8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep63Q3UPP8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep63Q3UPP8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep63Q3UPP8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep63Q3UPP8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep63Q3UPP8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep63Q3UPP8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep63Q3UPP8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep63Q3UPP8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep63Q3UPP8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep63Q3UPP8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep63Q3UPP8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep63Q3UPP8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cep63Q3UPP8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep63Q3UPP8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep63Q3UPP8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms