Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3UPC7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q3UPC7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3UPC7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3UPC7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3UPC7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UPC7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3UPC7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UPC7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UPC7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UPC7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UPC7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3UPC7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms