Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem253Q3UNB8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Tmem253Q3UNB8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Tmem253Q3UNB8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Tmem253Q3UNB8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem253Q3UNB8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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