Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln5Q3UMW8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cln5Q3UMW8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms