Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Parp3Q3ULW8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Parp3Q3ULW8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Parp3Q3ULW8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms