Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf3b2Q3UJB0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms