Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc177Q3UHB8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms