Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arfgef3Q3UGY8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arfgef3Q3UGY8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms