Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGK8

Gm5113, Predicted gene 5113, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5113Q3UGK8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5113Q3UGK8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5113Q3UGK8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5113Q3UGK8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5113Q3UGK8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5113Q3UGK8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5113Q3UGK8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5113Q3UGK8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5113Q3UGK8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5113Q3UGK8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5113Q3UGK8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5113Q3UGK8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5113Q3UGK8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5113Q3UGK8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5113Q3UGK8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5113Q3UGK8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms