Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft2Q3UF64 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft2Q3UF64 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms