Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Puf60Q3UEB3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Puf60Q3UEB3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms