Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trafd1Q3UDK1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trafd1Q3UDK1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms