Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3U6N9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3U6N9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3U6N9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3U6N9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3U6N9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q3U6N9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U6N9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Q3U6N9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms