Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U595 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U595 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U595 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U595 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U595 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U595 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U595 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U595 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U595 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U595 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U595 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U595 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U595 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U595 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U595 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U595 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U595 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U595 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U595 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U595 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U595 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U595 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U595 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U595 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U595 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U595 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U595 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U595 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U595 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U595 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U595 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U595 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U595 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U595 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U595 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U595 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U595 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U595 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U595 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U595 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U595 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U595 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U595 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U595 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U595 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U595 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U595 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U595 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U595 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U595 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U595 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms