Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gse1Q3U3C9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gse1Q3U3C9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gse1Q3U3C9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gse1Q3U3C9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gse1Q3U3C9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gse1Q3U3C9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gse1Q3U3C9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gse1Q3U3C9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gse1Q3U3C9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gse1Q3U3C9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gse1Q3U3C9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gse1Q3U3C9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gse1Q3U3C9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gse1Q3U3C9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gse1Q3U3C9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gse1Q3U3C9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gse1Q3U3C9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gse1Q3U3C9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms