Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl4Q3TZA2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdkl4Q3TZA2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdkl4Q3TZA2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdkl4Q3TZA2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl4Q3TZA2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms