Protein–RNA interactions for Protein: Q3TY92

Mbd6, Methyl-CpG-binding domain protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd6Q3TY92 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mbd6Q3TY92 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd6Q3TY92 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms