Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

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Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnnm2Q3TWN3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnnm2Q3TWN3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms