Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRR0

Map9, Microtubule-associated protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map9Q3TRR0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Map9Q3TRR0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Map9Q3TRR0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Map9Q3TRR0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Map9Q3TRR0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Map9Q3TRR0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Map9Q3TRR0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Map9Q3TRR0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Map9Q3TRR0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Map9Q3TRR0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Map9Q3TRR0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Map9Q3TRR0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Map9Q3TRR0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Map9Q3TRR0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Map9Q3TRR0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Map9Q3TRR0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Map9Q3TRR0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Map9Q3TRR0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Map9Q3TRR0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Map9Q3TRR0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Map9Q3TRR0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Map9Q3TRR0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Map9Q3TRR0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Map9Q3TRR0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Map9Q3TRR0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Map9Q3TRR0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Map9Q3TRR0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Map9Q3TRR0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Map9Q3TRR0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Map9Q3TRR0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Map9Q3TRR0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Map9Q3TRR0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Map9Q3TRR0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Map9Q3TRR0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Map9Q3TRR0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Map9Q3TRR0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Map9Q3TRR0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms