Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Calr4Q3TQS0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Calr4Q3TQS0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms