Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
XylbQ3TNA1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms