Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp39Q3TIX9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp39Q3TIX9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms