Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc13Q3TIR1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc13Q3TIR1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms