Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RubcnlQ3TD16 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RubcnlQ3TD16 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms