Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VrtnQ3SYK4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VrtnQ3SYK4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms