Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccbe1Q3MI99 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccbe1Q3MI99 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms