Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trpm1Q2TV84 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trpm1Q2TV84 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trpm1Q2TV84 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trpm1Q2TV84 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trpm1Q2TV84 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Trpm1Q2TV84 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trpm1Q2TV84 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trpm1Q2TV84 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpm1Q2TV84 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpm1Q2TV84 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpm1Q2TV84 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms